缅甸在13世纪中叶，由蒲甘王朝统治，当时正值中国的元朝帝王忽必烈统一封建帝国时期。1271年至1278年忽必烈用了七年的时间将缅甸攻下。1286年开始元朝在今缅甸的境内设立了一个特殊的军事行中书省，即缅中行省。与其他的行中书省不同，缅国（蒲甘王朝）并没有因为该行省的设立而消失，依旧沿袭了以往的各种生活行政制度，相当于现在中国的特别行政区。

元朝军队在缅甸建筑了栖水利工程（在今曼德勒的南部），并且开凿了墩兑运河，并且至今为缅甸的人民所用。这两项水利工程给缅甸的农业发展起到了很大的作用。并且今缅北的玉石矿是由云南的一个小商贩发现，开采玉石的技术也是中国传入缅甸的。

至明朝的时期，今缅甸境内的各王邦部落大多主动接受明朝的土司设置，臣属明朝，并且通过“朝贡”方式与中国保持着密切的政治联系。而明朝在缅甸设置土司都归云南承布政使司管辖。双方密切的政治关系，使经济交流呈现繁盛景象。缅甸生产的瓦、铜、铁、陶以及漆器技术多是中国的汉人传授的。

在16世纪中叶，缅甸南部的东吁王朝崛起，迫使缅甸境内的各王邦部落受其统治，并且向云南发起战争。在当时木邦的土官罕拔想要向明朝报请袭职，但是云南官吏却借机想要勒索，拒不发给承袭的状纸，罕拔从而反叛明朝，投向了东吁。明朝从而丧失了大片疆土，民谚说：“官府爱惜一张纸，丢失地方二千里”。